V pátek 6. července 2012 zasáhl Gelendžik silný liják a během několika hodin padly tříměsíční srážky. V důsledku toho začala povodeň. V době likvidace jejích následků byl v letovisku vyhlášen nouzový režim a pláže Gelendzhik byly uznány za nebezpečné ke koupání.
Ihned po nekontrolovatelné katastrofě, která zasáhla tři města na Krasnodarském území (Krymsk, Novorossijsk a Gelendžik), Rospotrebnadzor důrazně doporučil, aby rekreanti v Gelendžiku dočasně upustili od koupání v Černém moři. To bylo způsobeno zvýšeným rizikem kontaminace vody po povodni.
Podle Interfaxu mořská voda v Gelendžiku, která byla silně zasažena povodněmi, nesplňovala stávající normy; 48 ze 64 pláží bylo ve městě uzavřeno. Zaměstnanci společnosti Rospotrebnadzor poznali zbytek na pouhých 16 plážích jako bezpečný pro zdraví. Na místech, kde bylo zakázáno koupání, byly vyvěšeny černé vlajky.
Všechna omezení se plánovala zrušit, jakmile laboratorní testy mořské vody a písku na městských plážích přinesou pozitivní nebo uspokojivé výsledky. Bylo odebráno 88 vzorků vody a byla přijata řada opatření ke zlepšení jejích mikrobiologických parametrů. Byla provedena další chlorace vody a ti, kteří přišli do styku s povodněmi - nezbytná očkování.
Jen několik dní po přírodní katastrofě učinil hlavní sanitární lékař Ruska Gennadij Oniščenko prohlášení o souladu bakteriologických analýz vody (mořské a vodovodní) s normami kvality SES a se všemi zákazy koupání na plážích Gelendžikova byla zrušena.
Odborníci zajišťují, že nemá smysl skrývat negativní informace. Především proto, že situace v městech zasažených povodněmi je pod zvláštní kontrolou a odpovědnost i za jednoho nemocného, nemluvě o epidemii, připadne na zástupce Rospotrebnadzor.
Jak potvrzují lékaři místní nemocnice s infekčními chorobami, ke konci července 2012 k nim nebyl přijat ani jeden pacient s podezřením na nemoci spojené se znečištěním mořské vody.